Smaragdvaraner lever alene i naturen, men hannerne opsøger dog hunnerne i forbindelse med parring.
Hunnerne lægger efterfølgende deres æg i træhængende termitbo, så ungerne kan leve af termitterne og deres æg, efter de er udklækket.
Smaragdvaranen lever i oppe træerne. Den har store skæl på fødderne og en tynd krop, så den bedre kan holde balancen og stå fast på tynde grene. Hertil bruges halen til at gribe fat om grene.
I modsætning til andre varaner forsøger smaragdvaranen altid at beskytte sin hale frem for at bruge den som forsvarsmekanisme.